Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms