Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms