Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms