Protein–RNA interactions for Protein: D3Z291

Calhm1, Calcium homeostasis modulator protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm1D3Z291 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm1D3Z291 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm1D3Z291 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms