Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rexo5D3YW29 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms