Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm4950D3YUM8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Gm4950D3YUM8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm4950D3YUM8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm4950D3YUM8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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