Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms