Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
1700018F24RikB2RW27 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms