Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hbb-bh2B2RVB7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms