Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef20B1ARV6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef20B1ARV6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef20B1ARV6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef20B1ARV6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef20B1ARV6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef20B1ARV6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef20B1ARV6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef20B1ARV6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef20B1ARV6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef20B1ARV6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef20B1ARV6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef20B1ARV6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef20B1ARV6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef20B1ARV6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef20B1ARV6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef20B1ARV6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef20B1ARV6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef20B1ARV6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef20B1ARV6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms