Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCHNA4D1U4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LCHNA4D1U4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms