Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2al1jA2BFR3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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