Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pabpc1lA2A5N3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms