Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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