Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms