Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp5Q9Z2P8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp5Q9Z2P8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms