Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF8

Tusc2, Tumor suppressor candidate 2, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc2Q9WVF8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tusc2Q9WVF8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tusc2Q9WVF8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tusc2Q9WVF8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tusc2Q9WVF8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc2Q9WVF8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc2Q9WVF8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc2Q9WVF8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc2Q9WVF8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc2Q9WVF8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc2Q9WVF8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc2Q9WVF8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc2Q9WVF8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc2Q9WVF8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc2Q9WVF8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc2Q9WVF8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc2Q9WVF8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc2Q9WVF8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc2Q9WVF8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc2Q9WVF8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tusc2Q9WVF8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tusc2Q9WVF8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tusc2Q9WVF8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tusc2Q9WVF8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tusc2Q9WVF8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tusc2Q9WVF8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tusc2Q9WVF8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tusc2Q9WVF8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tusc2Q9WVF8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms