Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stub1Q9WUD1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Stub1Q9WUD1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms