Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrf1Q9WU00 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nrf1Q9WU00 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms