Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cul1Q9WTX6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cul1Q9WTX6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cul1Q9WTX6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cul1Q9WTX6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cul1Q9WTX6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cul1Q9WTX6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cul1Q9WTX6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cul1Q9WTX6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cul1Q9WTX6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cul1Q9WTX6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cul1Q9WTX6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cul1Q9WTX6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cul1Q9WTX6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cul1Q9WTX6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul1Q9WTX6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul1Q9WTX6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul1Q9WTX6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul1Q9WTX6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul1Q9WTX6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul1Q9WTX6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul1Q9WTX6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul1Q9WTX6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul1Q9WTX6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul1Q9WTX6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul1Q9WTX6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul1Q9WTX6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul1Q9WTX6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul1Q9WTX6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms