Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp21Q9QZL6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp21Q9QZL6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp21Q9QZL6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms