Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps29Q9QZ88 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms