Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd1Q9QY80 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms