Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp3Q9QY23 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 672.7 ms