Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms