Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc2lQ9JME7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms