Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gkap1Q9JMB0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gkap1Q9JMB0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms