Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx5Q9JKQ4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx5Q9JKQ4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx5Q9JKQ4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms