Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efcc1Q9JJF6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms