Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms