Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG8

Praf2, PRA1 family protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Praf2Q9JIG8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Praf2Q9JIG8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Praf2Q9JIG8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms