Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Wdr61Q9ERF3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms