Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Capn12Q9ER56 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn12Q9ER56 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms