Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trmt112Q9DCG9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trmt112Q9DCG9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms