Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Xab2Q9DCD2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Xab2Q9DCD2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Xab2Q9DCD2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Xab2Q9DCD2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Xab2Q9DCD2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Xab2Q9DCD2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Xab2Q9DCD2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Xab2Q9DCD2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Xab2Q9DCD2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Xab2Q9DCD2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Xab2Q9DCD2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Xab2Q9DCD2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Xab2Q9DCD2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Xab2Q9DCD2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms