Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBV4

Mxra8, Matrix remodeling-associated protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mxra8Q9DBV4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mxra8Q9DBV4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mxra8Q9DBV4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mxra8Q9DBV4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mxra8Q9DBV4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mxra8Q9DBV4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mxra8Q9DBV4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mxra8Q9DBV4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mxra8Q9DBV4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mxra8Q9DBV4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mxra8Q9DBV4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mxra8Q9DBV4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mxra8Q9DBV4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mxra8Q9DBV4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mxra8Q9DBV4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mxra8Q9DBV4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mxra8Q9DBV4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mxra8Q9DBV4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mxra8Q9DBV4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mxra8Q9DBV4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mxra8Q9DBV4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Mxra8Q9DBV4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mxra8Q9DBV4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mxra8Q9DBV4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mxra8Q9DBV4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mxra8Q9DBV4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mxra8Q9DBV4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mxra8Q9DBV4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mxra8Q9DBV4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mxra8Q9DBV4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms