Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SrpraQ9DBG7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms