Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms