Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms