Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms