Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V2

Lysmd2, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd2Q9D7V2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lysmd2Q9D7V2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms