Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms