Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4931428L18RikQ9D4S9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms