Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ribc2Q9D4Q1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ribc2Q9D4Q1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ribc2Q9D4Q1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ribc2Q9D4Q1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ribc2Q9D4Q1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ribc2Q9D4Q1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ribc2Q9D4Q1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ribc2Q9D4Q1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ribc2Q9D4Q1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ribc2Q9D4Q1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ribc2Q9D4Q1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ribc2Q9D4Q1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ribc2Q9D4Q1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ribc2Q9D4Q1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ribc2Q9D4Q1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ribc2Q9D4Q1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ribc2Q9D4Q1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ribc2Q9D4Q1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ribc2Q9D4Q1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ribc2Q9D4Q1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ribc2Q9D4Q1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ribc2Q9D4Q1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms