Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K4

Fancd2os, FANCD2 opposite strand protein, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fancd2osQ9D4K4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fancd2osQ9D4K4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms