Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sohlh2Q9D489 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sohlh2Q9D489 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sohlh2Q9D489 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sohlh2Q9D489 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sohlh2Q9D489 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sohlh2Q9D489 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sohlh2Q9D489 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sohlh2Q9D489 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sohlh2Q9D489 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sohlh2Q9D489 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sohlh2Q9D489 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sohlh2Q9D489 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sohlh2Q9D489 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sohlh2Q9D489 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sohlh2Q9D489 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sohlh2Q9D489 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sohlh2Q9D489 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sohlh2Q9D489 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sohlh2Q9D489 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sohlh2Q9D489 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sohlh2Q9D489 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sohlh2Q9D489 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sohlh2Q9D489 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sohlh2Q9D489 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sohlh2Q9D489 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sohlh2Q9D489 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sohlh2Q9D489 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms