Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q5

Serpinb3b, MCG21235, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Serpinb3bQ9D1Q5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Serpinb3bQ9D1Q5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Serpinb3bQ9D1Q5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Serpinb3bQ9D1Q5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Serpinb3bQ9D1Q5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Serpinb3bQ9D1Q5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Serpinb3bQ9D1Q5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Serpinb3bQ9D1Q5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Serpinb3bQ9D1Q5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Serpinb3bQ9D1Q5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Serpinb3bQ9D1Q5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Serpinb3bQ9D1Q5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Serpinb3bQ9D1Q5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Serpinb3bQ9D1Q5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Serpinb3bQ9D1Q5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Serpinb3bQ9D1Q5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Serpinb3bQ9D1Q5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms