Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms