Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK4

Slc50a1, Sugar transporter SWEET1, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc50a1Q9CXK4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc50a1Q9CXK4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms