Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Xrcc3Q9CXE6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Xrcc3Q9CXE6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Xrcc3Q9CXE6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Xrcc3Q9CXE6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc3Q9CXE6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms